Montagem, anotação e análise comparativa do genoma mitocondrial de formiga cultivadora de fungo Mycetophylax conformis (Mayr, 1884).

Abstract

O DNA mitocondrial tem sido usado em estudos de diversos organismos acerca do conhecimento e composição de bancos de dados científicos visando o desenvolvimento de pesquisas em diversas áreas incluindo a biotecnologia. Um dos organismos alvos desse tipo de estudo são as formigas devido interesse em estudos de filogenia, evolução e marcadores moleculares. A espécie de formiga Mycetophylax conformis cultivadora de fungo simbionte basidiomiceto que habita ecossistemas de restinga possui poucos dados na literatura a respeito de seu genoma mitocondrial e potencial biotecnológico. Assim, o estudo propôs conhecer as bases genéticas envolvidas na composição do genoma mitocondrial de M. conformis para o fomento de bancos de dados genéticos. Para tanto realizou-se amostragem e extração do material genético seguido de sequenciamento, montagem e anotação. O genoma mitocondrial montado apresentou tamanho inferior ao de outras espécies de formiga com 14804 pb, sendo 22 genes de RNAs transportadores, 2 genes de RNAs ribossômicos, 13 genes codificadores de proteínas e região controle. Analisando a composição nucleotídica, 79% do mitogenôma é composto por A e T, os valores de ATskew e GCskew foram negativos, revelando assimetrias tendendo para mais bases T do que A e mais bases C do que G. O mitogenoma possui poucos espaços intergênicos e algumas sobreposições. Os genes codificadores de proteínas nad1, nad2 e nad6 envolvidos no Complexo I apresentaram tamanhos pequenos levantando questionamentos sobre sua função. Contudo, os demais genes esperados em um genoma mitocondrial foram encontrados em posições semelhantes à de outras espécies de formiga exceto pelo gene trnW que neste genoma encontra-se na fita negativa. Insights sobre o potencial biotecnológico são abordados no tocante a capacidade de modificação do habitat e sobrevivência em ambientes inóspitos que estas formigas possuem, ressaltando a importância do conhecimento destes organismos no desenvolvimento de estudos biotecnológicos.