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Título: Caracterização inicial dos constituintes da maquinaria de silenciamento gênico mediada por microRNAs em Schistosoma mansoni.
Autor(es): Gomes, Matheus de Souza
Orientador(es): Cota, Renata Guerra de Sá
Palavras-chave: Schistosoma mansoni
Código genético
Reação em cadeia de polimerase
Biologia molecular
Data do documento: 2008
Editora / Evento / Instituição: Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas. Núcleo de Pesquisas em Ciências Biológicas, Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós Graduação, Universidade Federal de Ouro Preto.
Referência: GOMES, M. de S. Caracterização inicial dos constituintes da maquinaria de silenciamento gênico mediada por microRNAs em Schistosoma mansoni. 2008. 112 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal de Ouro Preto, Ouro Preto, 2008.
Resumo: O silenciamento de RNA refere-se a uma série de processos nucleares e citoplasmáticos envolvidos na regulação da expressão gênica pós-transcricional ou silenciamento pós-transcricional (PTGS), degradando ou silenciando seqüências específicas de mRNA. O mecanismo é conservado em animais incluindo alguns pontos distintos e vários pontos coincidentes, envolvidos tanto no silenciamento de pequenos RNAs por via endógena quanto por via exógena. O pequeno RNA melhor caracterizado é o microRNA (miRNAs), que predominantemente silencia genes através de uma regulação pós-transcricional. Neste trabalho, utilizamos bioinformática para identificar possíveis genes envolvidos na via de silenciamento gênico pós-transcricional mediado por miRNA em S. mansoni. Nós pesquisamos os bancos de dados do genoma e do transcriptoma de S. mansoni, com as seqüências de aminoácidos proteínas ortólogas relacionadas à via de miRNA. Identificamos o total de 13 prováveis proteínas envolvidas na via miRNA no parasito. Em seguida, o níveis de SmDicer1 e SmAgo 2, 3 e 4 foram identificados por qRT-PCR utilizando cercárias, vermes adultos, ovos e esquistossômulos com os seguintes períodos de cultivo in vitro 3,5; 8,5; 18,5; 24; 48 e 72 horas. Este resultado demonstrou que, os dois genes são diferencialmente expressos através do período de diferenciação cercária-esquistossômulo, tendo níveis similares em ovos e vermes adultos. Em cercárias SmDicer1 tem baixa expressão. Estes resultados sugerem que esta via é um importante mecanismo de regulação da expressão gênica neste parasita. Futuros experimentos são necessários para provar esta hipótese.
Resumo em outra língua: RNA silencing refers to a series of nuclear and cytoplasmatic processes involved in the post-transcriptional regulation of gene expression or post-transcriptional gene silencing (PTGS), either by sequence-specific mRNA degradation or by translational arrest. The mechanism is conserved in animals and includes at least distinct pathways with several overlapping points, involved on silencing of endogenous or exogenous sequences. The best characterized small RNA is microRNAs (miRNAs), which predominantly makes genes silencing through post-transcriptional mechanisms. In this work we used bioinformatics approach to identity gene products in parasitic trematode S. mansoni with sharing similarities with enzymes involved in the post-transcriptional gene silencing mediated by miRNA pathway. We searched the S. mansoni genome and transcriptome databases, with the amino acid sequences of othologs proteins related to the miRNA pathway. We identified the total of 13 putative proteins involved in miRNA pathway in the parasite. Next, the levels of SmDicer1 and SmAgo 2, 3 and 4 were identified by qRT-PCR using cercariae, adult worms, eggs and schistosomula with the following times of in vitro cultivation 3,5; 8,5; 18,5; 24; 48 and 72 hours. This results shown that, the two genes are differentially expressed through cercariae-schistosomula differenciation, and have similar levels in eggs, and adult worms. In cercariae SmDicer1 is down-regulated. These results suggest that this pathway is an important mechanism for the regulation of gene expression in this parasite. Future experiments are needed to prove this hypothesis.
URI: http://www.repositorio.ufop.br/handle/123456789/2679
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